造成公司损失扣工资合法，但需按规定执行。依据《工资支付暂行规定》，公司可要求赔偿并从工资中扣除，但每月扣除不得超过工资的20%，且不得低于最低工资标准。否则，可能面临法律风险及员工投诉。
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造成损失扣工资需谨慎。操作如下：1. 确认损失并收集证据；2. 与员工沟通，尝试协商赔偿；3. 如协商无果，根据《工资支付暂行规定》扣除工资，确保不超过20%且不低于最低工资；4. 若损失巨大或员工不认可，建议寻求法律援助。
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处理员工造成损失的方式包括扣款、协商赔偿或法律途径。选择时应考虑损失大小、证据充分性及员工承受能力。若损失小且证据确凿，可直接扣款；若损失大或证据不足，建议协商或诉诸法律。