土地承包经营权确认纠纷应由土地所在地法院管辖。依据《民事诉讼法》，土地纠纷由不动产所在地法院专属管辖，不及时处理可能导致权益受损。
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土地承包纠纷处理：1. 协商：双方直接沟通，尝试达成一致。2. 调解：若协商无果，可申请相关机构调解。3. 诉讼：调解无效，则向土地所在地法院提起诉讼，确保权益得到保护。
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处理土地承包经营权确认纠纷，常见方式为协商、调解或诉讼。首先尝试与对方协商，协商不成可寻求调解，仍无果则向法院提起诉讼，由土地所在地法院受理。